Associate professor
SSD: Informatics (INFO-01/A)
President of the first-cycle degree course in COMPUTER SCIENCE
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Curriculum Vitae

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Vincenzo Bonnici is an Associate Professor in Informatics at the Department of Mathematical, Physical and Computer Science of the University of Parma (Italy).  He received a bachelor’s degree and a master’s degree in Computer Science from the University of Catania (Italy) in 2008 and 2011, respectively. He received a PhD in Computer Science from the University of Verona in 2015. From 2013 to 2014, he was a Visiting Researcher Scholar at the Institute for Genomics and Bioinformatics (IGB), University of California, Irvine, and in 2017, he did an internship at the Fondazione per la Ricerca e la Cura dei Linfomi del Ticino, Istituto Oncologico della Svizzera Italiana, Bellinzona. From 2015 to 2019, he was a research associate, and from 2019 to 2021, he was an Assistant Professor at the University of Verona .


Bioinformatics, Artificial intelligence, computational biology, algorithms and data structures, graph theory, and parallel computing are Vincenzo Bonnici's main research interests. He has worked on the search of substructures within biomedical graphs, since his master’s degree period. He has extended such topic to the creation, integration, and creation of biological networks. His research topics also include computational genomics by developing innovative methods based on Information Theory for the analysis of genomic sequences. Phylogenomic and pangenomics are also among his research interests in which he studies computational methods for computing homology among biological sequences. He has also worked in the System Biology field by studying the  physical and functional relations of non-coding RNAs. Parallel computing is a cross-cutting theme for his research studies, and he has developed parallel solutions on top of different architectures, from SMPs to GP-GPUs. As a result of his research activities, he has published several papers in relevant scientific journals (Bioinformatics, BMC, IEEE/ACM TCBB, Nature – Scientific Reports), he won an international contest on graph matching within the 2014 ICPR conference and a best poster award at the  Jacob T. Schwartz International School for Scientific Research, and he has been speaker at 12 international scientific conferences.
 

Positions

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Teaching

Research

Publications

Research projects

  • Una tassonomia Biomolecolare, delle Biofonti e delle Bioattività per liberare il potenziale della Biodiversità attraverso una piattaforma basata sul Web

    Manager: Bonnici Vincenzo

Public Engagement Initiatives

  • Dal computer alla cellula (e ritorno): un ponte tra intelligenza artificiale e biologia

    Cosa hanno in comune un algoritmo e il nostro DNA? Molto più di quanto immaginiamo. Spesso pensiamo all’Intelligenza Artificiale come a una tecnologia futuristica, ma il suo legame con la vita è profondo e antico. La Bioinformatica è la chiave di lettura di questo dialogo a due voci. In questo incontro esploreremo come le tecniche computazionali, dagli strumenti classici (in tempi non sospetti) fino alle moderne AI generative, abbiano rivoluzionato la scienza. Vedremo come oggi sia possibile non solo ottenere diagnosi rapide, ma persino ingegnerizzare e selezionare batteri e virus per applicazioni che spaziano dalle terapie mediche avanzate ai processi industriali. Ma il viaggio è a doppio senso: scopriremo come la biologia abbia insegnato all’informatica come “pensare”. Dalle reti neurali che imitano il cervello agli algoritmi che replicano l’evoluzione, vedremo come la natura sia stata la prima ispiratrice della tecnologia. Un viaggio affascinante tra bit e cellule, per comprendere come l’alleanza tra vivente e artificiale stia disegnando il nostro futuro.

  • Notte dei ricercatori - Sfida L'algoritmo

    Notte dei ricercatori 2025 - Organizzazione e partecipazione del laboratorio "Sfida l'algoritmo"

  • Caccia al tesoro della Scienza

    L’iniziativa mette in gioco tutte le competenze presenti al Campus. Le attività sono rivolte ai bambini della scuola primaria. Seguendo un percorso che li porterà ad incontrare le varie sfaccettature della Scienza nei luoghi dove viene insegnata e sperimentata, i bambini vengono stimolati a rispondere a quesiti specifici per ogni disciplina (chimica, fisica, biologia, matematica et…).

  • Bootcamp di programmazione in Python 2025

    ll bootcamp di programmazione in Python è rivolto agli studenti e alle studentesse delle classi III, IV e V delle scuole secondarie di secondo grado. Il bootcamp è incentrato sullo sviluppo di semplici algoritmi in Python che tramite la tecnica della gamification permettano di apprendere i principali costrutti di tale linguaggio.

  • Caccia al tesoro della Scienza

    L’iniziativa mette in gioco tutte le competenze presenti al Campus. Le attività sono rivolte ai bambini della scuola primaria. Seguendo un percorso che li porterà ad incontrare le varie sfaccettature della Scienza nei luoghi dove viene insegnata e sperimentata, i bambini verranno stimolati a rispondere a quesiti specifici per ogni disciplina (chimica, fisica, biologia, matematica et…).

  • Notte dei ricercatori 2024 - Organizzazione e partecipazione del laboratorio "Sfida l'algoritmo"

    L’attività prevede di mettere alla prova le proprie capacità logico-deduttive (risolvere un labirinto o ordinare degli oggetti) mentre il computer affronta lo stesso rompicapo. Riuscirai a trovare la soluzione in meno mosse del computer? Questa dimostrazione permette di affrontare i concetti informatici di pensiero computazionale e di algoritmo in modo pratico e divertente. Il livello di difficoltà e di dettaglio è tarato in base all’età.

  • Notte dei ricercatori 2024 - Organizzazione e partecipazione del laboratorio "Sfida l'algoritmo"

    Notte dei ricercatori 2024 - Organizzazione e partecipazione del laboratorio "Sfida l'algoritmo"

  • PLS Azione E - Crescita Professionale dei Docenti della Scuola Secondaria Superiore.

    E’ prevista una attività di creazione di contenuti rivolti agli insegnati delle scuole secondarie per guidare loro nella creazione e gestione di laboratorio per gli studenti e le studentesse delle classi IV e V riguardante temi legati alla Informatica. In particolare, verranno creati dei contenuti divulgati sulle tematiche dell’algoritmica e del problem solving. Tale materiale sarà propedeutico per la creazione di laboratori di introduzione agli algoritmi e alle strutture dati che sono di base per le moderne intelligenze artificiali. Come esempio pratico sarà preso in considerazione il problema di trovare un percorso per uscire da un labirinto.

  • Piano Lauree Scientifiche di Informatica - Azione C - Bootcamp di programmazione in Python

    l bootcamp di programmazione in Python è rivolto agli studenti e studentesse delle classi IV e V delle scuole secondarie di secondo grado e del primo anno del Corso di Laure in Informatica. Il bootcamp è incentrato sullo sviluppo di semplici algoritmi in Python che tramite la tecnica della gamification permettano di apprendere i principali costrutti di tale linguaggio. L’interazione tra studenti delle scuole secondarie e studenti del primo anno di Laurea consente uno scambio diretto della esperienza universitaria.

  • Notte dei ricercatori 2023 - Organizzazione e partecipazione del laboratorio "Sfida l'algoritmo"

    Notte dei ricercatori 2023 - Organizzazione e partecipazione del laboratorio "Sfida l'algoritmo"

  • "Upskilling for teachers in tech-related courses for refugees" (organizzato da Informatici Senza Frontiere)

    L’obiettivo della “quattro giorni”, che si svolge nell’ambito del progetto "Upskilling for teachers in tech-related courses for refugees", è formare i partecipanti (alcuni docenti di informatica della scuola croata Migracode per la formazione digitale dei migranti) sul tema delle capacità di insegnamento e sul lavoro con rifugiati e migranti nell'educazione tecnologica, cercando di accrescere le loro competenze nelle metodologie di insegnamento delle materie scientifiche, matematica e informatica in particolare. La formazione sarà curata dai componenti di Informatici Senza Frontiere. Tra questi Vincenzo Bonnici , docente di Informatica all’Università di Parma e organizzatore locale dell’appuntamento.

  • Orientamento

    Orientamento presso ITIS Galilei di San Secondo Parmense.

  • Notte dei ricercatori - Organizzazione e partecipazione alla attività interattiva "Sfida l'algoritmo"

    notte dei ricercatori a Parma, zona campus

  • Orientamento al corso di laurea triennale

    Orientamento al corso di laurea triennale per il liceo Marconi di Parma

  • Intervento al PI greco day

    Intervento al PI greco day

  • 11 e 14 marzo: tre incontri per celebrare la Giornata Internazionale della Matematica

    Tre seminari divulgativi “Operazioni: elementari, ma non troppo!” “Storia di Pi” “Caratterizzazione di sequenze casuali” per celabrare la Giornata Internazionale della Matematica

  • Orientamento

    Orientamento per il corso di laurea triennale al liceo Bertolotti di Parma

  • Presentazione del Corso di Laurea Triennale in Informatica della’ Unviersità degli Studi di Parma, durante la giornata Open Days presso ISIS San Secondo (Parma)

    Presentazione del Corso di Laurea Triennale in Informatica della’ Unviersità degli Studi di Parma, durante la giornata Open Days presso ISIS San Secondo (Parma)

  • Big data analytics e predictive maintenance

    Corso di formazione per l'azienda ACMI

  • Relatore all’evento “How to choose a PhD” organizzato da ISCB-Italia.

    Relatore all’evento “How to choose a PhD” organizzato da ISCB-Italia.

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